slog, По вашему вопросу:
1.Например, предположим, что ваша ось 32разрядная. А оперативы надо воткнуть много. Или хотя бы 4 гига. (правда, на современных дистрах и дефолтное ядро на 32разрядной оси может поддерживать 4 гига= там это уже включено.)
2.Далее, напрмер в 5м Дебиане по дефолту в конфиге ядра выключена опция low latency desktop (соррри за рязанский акцент), так вот. (правда, я после сборки с низким этим откликом разницы не увидел, но это уже от машины зависит, у меня и так все быстро было).
3.Кроме того, ядро можно собрать без initrd, который, как известно, нужен скорее при установке системы, чем при ее работе, и является костылем (http://welinux.ru/post/3309/).
4.....продолжая мысль 3го пункта, раз уж ядро без initrd, то и полностью монолитным его надо сделать, то есть вообще без модулей.(для этого надо строго в нем только необходимое оставить).Что касается возражений, "а если придет друг с принтером на парал порт?!, поддержку которого вы из ядра выкинули?"= так в меню загрузки оставьте пункт с дефолтным ядром, для такого друга.
5. В некоторых дистрах, разработчики сильно патчат ядро, насколько помню, например , в мандриве. И про федору вашу, что-то в этом плане меня терзают смутные сомнеья. Эт я к чему: не во всех дистрах одинаково удобно собирать ядра. (Например в Дебиане, это донельзя автоматизировано и удобно :) ).