Да уж насоветовали... ну во первых в GRUB2 можно писать вручную только в /etc/default/grub ибо после update-grub всё будет создано на его основе.
Восстановить винду ценой убунты, можно загрузившись с виндового компакт диска в консоль восстановления и выполнить там fixmbr и fixboot если очень нужно.
Потом убунту можно и переставить, лучше с оригинального диска убунты.
Графический редактор GRUB2 - Grub Customizer, можно установить из PPA. В Ubuntu Tweak он уже есть вроде.
В редакторе внимательно посмотреть, что за чертовщина творится и включён ли скрипт os-prober - обычно именно он детектит разделы с виндой.
Вывод cat /boot/grub/grub.cfg в случае, когда всё в порядке должен содержать такой раздел:
### BEGIN /etc/grub.d/30_os-prober ###
menuentry "Windows NT/2000/XP (loader) (on /dev/sda1)" {
insmod part_msdos
insmod ntfs
set root='(hd0,msdos1)'
search --no-floppy --fs-uuid --set 6c94e7dd94e7a7b2
drivemap -s (hd0) ${root}
chainloader +1
}
