Вопрос: а yum учитывает обновления от гуевой программы? Если нет, то я просто откатил не то что надо.
Теперь обновлюсь через yum и буду ждать подсказки где в конфигах полазить.
Учитывает. Все графические обновлялки - это просто графический интерфейс к yum.