Как только выполнил /etc/init.d/net.wlan0 -d start сеть пропала!
Так понятно, что пропадёт сеть ;)
Вы сначала «убейте» поднятый вручную интерфейс, потом пробуйте, т.е.
ifconfig wlan0 down
У вас графический режим есть или только консоль?
Если только консоль, установите и запустите поддежку мыши в консоли:
emerge -av sys-libs/gpm
/etc/init.d/gpm start
...далее с помощью мыши скопируйте весь вывод.
А не пробовали с помощью wgetpaste скопировать?
Т.е.
wgetpaste -c '/etc/init.d/net.wlan0 -d start'
...или
/etc/init.d/net.wlan0 -d start | wgetpaste