funtoo ни при чем https://bugs.gentoo.org/show_bug.cgi?id=402351 висит 3 дня UNCONFIRMED :) funtoo/gentoo tree идентичны на 95%, по-этому проблему (если пакет не принадлежит funtoo-overlay) нужно искать в gentoo.
tyrnov, примерно то же самое и делает, только revdep-rebuild ищет «битые» связи в реальном времени, а @preserved-rebuild — это создаваемый при установке/удалении список (set) зависящих друг от друга программ и библиотек.
Total: 1 package (1 downgrade), Size of downloads: 1,147 kB
Would you like to merge these packages? [Yes/No] yes
>>> Verifying ebuild manifests
>>> Emerging (1 of 1) dev-libs/libpcre-8.21
>>> Installing (1 of 1) dev-libs/libpcre-8.21
>>> Recording dev-libs/libpcre in "world" favorites file...
>>> Jobs: 1 of 1 complete Load avg: 1.45, 0.54, 0.23
>>> Auto-cleaning packages...
>>> No outdated packages were found on your system.
* GNU info directory index is up-to-date.
* IMPORTANT: config file '/etc/ssh/sshd_config' needs updating.
* See the CONFIGURATION FILES section of the emerge
* man page to learn how to update config files.
* IMPORTANT: 2 news items need reading for repository 'gentoo'.
* Use eselect news to read news items.
!!! existing preserved libs:
>>> package: dev-libs/libpcre-8.21
* - /lib64/libpcre.so.1
* - /lib64/libpcre.so.1.0.0
* used by /bin/grep (sys-apps/grep-2.10)
* used by /usr/bin/git (dev-vcs/git-1.7.9)
* used by /usr/bin/git-receive-pack (dev-vcs/git-1.7.9)
* used by 138 other files
Use emerge @preserved-rebuild to rebuild packages using these libraries
Вот в конце как раз портеже говорит об этих битых связях?