пара замечаний:
<www-servers/nginx-9999 ~amd64
эквивалентно www-servers/nginx ~amd64
sys-kernel/zen-sources:9999 ~amd64
должно быть: "sys-kernel/zen-sources:9999 **"
а мне бы было страшно жить на всём свежем и непроверенном... а вообще я стараюсь ограничивать версии, если ставлю из тестинг ветки... и не устанавливаю ничего нового, пока мне это реально не понадобится.