Lupo Alberto, рецепта нет случаем?
Отключить глобально semantic-desktop.
Затем
[console]emerge -auDNv --with-bdeps=y world[/console]
[console]emerge -av --depclean[/console]
...и о-о-очень постепенно устанавливать KDE, т.е. без всяких мета-пакетов, разбираясь, если что-то захочет вытащить nepomuk.
Если вы используете kmail, то ничего не получится — без semantic-desktop этот пакет откажется собираться. Возможно, есть ещё подобные пакеты.