Ну почему госконторы сидят на винде понятно - там проще распиливать и откатывать. А на СПО чиновнику свой карман не набить.
На самом деле на СПО пилить бюджет даже удобнее. При покупки лицензий большая часть суммы уходит за бугор, откат считанные проценты. А установка СПО - это услуги, можно выбрать исполнителя... ну и так далее.
Так что не переходят на СПО в первую очередь из-за лени и страха перемен.